Apa itu Acrylamide

Pengetahuan tentang dasar Acylamide sangat diperlukan dalam tahap pembuatan simulator Polyacrylamide ini. Saat tulisan ini ditulis, sebenarnya penulis belum mengerti sepenuhnya dengan arah pembuatan simulator. Apakah nama judul praktikum yang dimaksudkan adalah polyacrylamide, acrylamide saja atau dengan nama yang lain. Oleh karena itu, tulisan ini adalah sebagian keingin-tahuan penulis tenang tujuan diadakannya praktikum polyacrylamide. 

Dari foodstandards.gov.au dikatakan bahwa Acrylamide adalah zat kimia yang terbentuk pada makanan bertepung secara alami, ketika makanan tersebut dimasak. Meskipun acrylamide tidak ditemukan bukti dapat menyebabkan kanker pada manusia, namun terdapat bukti bahwa zat ini dapat menyebabkan kanker pada hewan laboratorium. Bukti lebih lanjut dapat dibaca di sini. Sedangkan menurut Andrew Don (2017), salah satu tanda yang paling mudah, bahwa suatu makanan memiliki kandungan acrylamide adalah perubahan warna yang coklat dan perbedaan rasa. Semakin coklat, semakin tinggi zat acrylamide yang terbentuk. 

Penulis sempat bingung, referensi di atas menunjukkan bahwa acrylamide adalah seperti tingkat “kegosongan” pada makanan, dan terasa aneh jika paktikum yang penulis buat simulatornya berhubungan dengan kerbau? 

Ternyata memang benar, penulis salah paham, acrylamide yang akan digunakan dalam praktikum ini, bukan acrylamide yang terdapat dalam makanan seperti di atas. Acrylamide yang dimaksud adalah sebuah larutan yang digunakan untuk membuat gel dalam proses electrophoresis, yang berguna untuk mengurutkan DNA, memisahkan protein, atau molekul berdasarkan berat dan muatan listriknya. Larutan pembuat gel acrylamide yang dimaksud adalah sebagaimana gambar dibawah ini: 

Bio-Rad: 30% Acrylamide/Bis Solution

Hal ini baru penulis pahami, ketika penulis mengerti bahwa tujuan praktikum ini adalah untuk menganalisa sampel darah kerbau. Yaitu untuk menganalisa DNA-nya. Meskipun penulis belum tahu akan diolah seperti apa dan diteliti bagian mananya saat tulisan ini ditulis, namun sudah dapat dipastikan, Acrylamide yang akan digunakan dalam penelitian ini dipergunakan sebagai gel untuk proses electrophoresis.

Selain itu, dugaan sementara alasan mengapa lebih menggunakan kata polyacrilamide dibandingkan kata acrylamide itu sendiri, adalah karena dalam praktikum menggunakan 2 jenis acrylamide. Yaitu acrylamide 10% sebagai resolving gel dan 5% sebagai stacking gel. Di mana dalam pembuatannya, dapat mengikuti resep di bawah ini (vlab.amrita.edu):

Resolving Gel
  • 30% Acrylamide 3.3 mL
  • 1.5M Tris, pH 8.8 2.5 mL
  • SDS 0.1 mL
  • dH2O 4.0 mL
  • Ammonium Persulphate 0.1 mL
  • TEMED 0.004 mL

Stacking Gel
  • 30% Acrylamide 1.65 mL
  • 0.5M Tris, pH 6.8 2.5 mL
  • SDS 0.1 mL
  • dH2O 5.65 mL
  • Ammonium Persulphate 0.1 mL
  • TEMED 0.004 mL

Resolving gel adalah gel yang digunakan pada bagian bawah plate, untuk proses electrophoresis pemisahan protein, sedangkan stacking gel adalah gel bagian atas plate yang digunakan untuk menempatkan sampel.

Sedangkan untuk nilai 10% dan 5% pada masing-masing gel, masih menjadi misteri bagi penulis, sampai tulisan ini ditulis dan akan dibahas pada tulisan berikutnya.

Referensi

Comments

Post a Comment

Catatan

Seluruh konten yang berada dalam blog ini, karena penulis juga masih belajar, konten dapat diubah sewaktu-waktu baik atau tanpa pemberitahuan sebelumnya.

Popular posts from this blog

Bahan-bahan Pembuatan Polyacrylamide Gel Electrophoresis

Image
Berdasarkan Wikipedia (2018) , PAGE (Polyacrylamide Gel Electrophoresis) adalah teknik pemisahan protein atau nucleic acids (yang lebih kita kenal dengan DNA atau RNA) ke molekul-molekul pembentuknya menggunakan gel. Pemisahan ini dapat sesuai karakteristik ukuran, berat, bentuk atau muatan molekul-molekul protein atau nucleic acids tersebut. Contohnya berdasarkan ukuran molekul, karena luas penampangnya semakin besar, maka semakin besar pula hambatan molekul untuk bergerak dalam gel. Penjelasan tentang proses electrophoresis ini sendiri, akan dijelaskan pada tulisan selanjutnya. Berikut ini adalah nama bahan-bahan dan berikut fungsinya dalam pembuatan gel, yang penulis himpun untuk mengetahui pengaruh volume terhadap bahan terhadap campuran resep gel, sebagai referensi pembuatan simulator praktikum polyakrilamide: Acrylamide Berupa larutan yang digunakan sebagai salah satu bahan utama pembuatan gel. Dalam praktikum ini, bahan praktikum menggunakan larutan acrylamide ...
Read more

Visualisasi Perbandingan Volume Bahan Gel Polyacrylamide

Image
Berikut ini adalah visualisasi perbandingan volume dalam resep pembuatan resolving gel dan stacking gel untuk praktikum Polyacrylamide: Resolving Gel 30% Acrylamide 3.3 mL 1.5M Tris, pH 8.8 2.5 mL SDS 0.1 mL dH 2 O 4.0 mL Ammonium Persulphate 0.1 mL TEMED 0.004 mL Stacking Gel 30% Acrylamide 1.65 mL 0.5M Tris, pH 6.8 2.5 mL SDS 0.1 mL dH 2 O 5.65 mL Ammonium Persulphate 0.1 mL TEMED 0.004 mL Dari kedua gambar di atas terlihat bahwa, yang membedakan hanyalah volume Acrylamide dan air destilasi. Dimana untuk stacking gel lebih banyak mengandung air (lebih encer), dikarenakan memang stacking gel adalah tempat penempatan sampel dan sebagai titik awal proses electrophoresis.
Read more